Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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