Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 WISP3-208ENST00000604763 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SMIM8-206ENST00000608353 2111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MIR6776-201ENST00000616678 59 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 OR5G5P-204ENST00000627642 621 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RAB5B-211ENST00000628569 496 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SPATA18-201ENST00000295213 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms