Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UTP11Q9Y3A2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms