Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PACSIN2Q9UNF0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PACSIN2Q9UNF0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PACSIN2Q9UNF0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN2Q9UNF0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms