Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLKQ9UBT6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms