Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms