Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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