Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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