Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2Q9BX26 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms