Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms