Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms