Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FYCO1Q9BQS8 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms