Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms