Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms