Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGF29Q96ES7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGF29Q96ES7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGF29Q96ES7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGF29Q96ES7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGF29Q96ES7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGF29Q96ES7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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