Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms