Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms