Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms