Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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