Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DUX4L9Q6RFH8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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