Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF449Q6P9G9 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF449Q6P9G9 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms