Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATL3Q6DD88 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms