Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms