Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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