Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms