Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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