Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms