Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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