Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CYTH1Q15438 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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CYTH1Q15438 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CYTH1Q15438 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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