Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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