Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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