Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms