Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms