Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CKAP5Q14008 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CKAP5Q14008 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CKAP5Q14008 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKAP5Q14008 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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