Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CBFBQ13951 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CBFBQ13951 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CBFBQ13951 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CBFBQ13951 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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