Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms