Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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