Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms