Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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BNIP1Q12981 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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BNIP1Q12981 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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BNIP1Q12981 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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BNIP1Q12981 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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