Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms