Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms