Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms