Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms