Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL3P58872 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms