Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms