Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3M2P53677 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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