Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PGGT1BP53609 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PGGT1BP53609 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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