Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms