Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms