Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA3P32297 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms